2001年3月，丽江教育学院和丽江民族师范学校合并，校名沿用丽江教育学院，下设纪委办公室、监审室。

2006年2月，丽江教育学院改制为丽江师范高等专科学校，下设纪委办公室、监审室。

2007年9月，学校纪检部门调整设置为纪委办公室、监察审计处，并合署办公。

2011年3月，纪委办公室、监察审计处调整设置为纪委办公室、监察审计处（督查室）。

2018年8月，纪委办公室、监察审计处（督查室）调整设置为纪委办公室（巡察工作领导小组办公室）、监察审计处，督查室并入党政办。

2019年5月，纪委办公室（巡察工作领导小组办公室）和监察审计处合并设置为纪检监察办公室（巡察工作领导小组办公室），审计处独立设置。

2020年11月，纪检监察办公室（巡察工作领导小组办公室）分设置为现纪委办公室、纪检处，并合署办公。

纪委办公室、纪检处在学校党委行政、校纪委的领导下开展工作，履行党的纪律检查和学校行政监督职能。